Емил Петров има почти 20 годишен стаж в съдебната система. Работи в държавното обвинение от 2000 г. Във Враца беше прокурор в районната прокуратура, откъдето е командирован от 2011 г. до 2015 г. в Софийска градска прокуратура. През 2016 г., след конкурс е работил там на постоянно място. Многократно е награждаван от бившия главен прокурор Сотир Цацаров за професионално изпълнение на служебните задължения.
Прокурор Емил Петров е брат на бившия следовател Петьо Петров, който беше основен свидетел по делото срещу бившия военен министър Николай Цонев, финансиста Тенчо Попов и съдия Петър Сантиров за подкуп, което окончателно приключи с оправдателна присъда преди пет години. През 2017 г. Петьо Петров напусна съдебната система.